El sistema de arrecifes coralinos de Cayos Miskitos, se ubica en la Región Autónoma de la Costa Caribe Norte de Nicaragua. Este ecosistema es de importancia para la conservación y el desarrollo humano, de acuerdo al modelo de vida que practican los pueblos indígenas de la Mosquita nicaragüense. Considerando esta realidad, la Universidad de las Regiones Autónomas de la Costa Caribe Nicaragüense (URACCAN) IREMADES y UICN, suscriben un convenio para desarrollar el proyecto: Fortalecimiento de condiciones y capacidades de la población para la conservación y manejo sostenible de ecosistemas costeros de la Costa Caribe.

Mediante este proyecto se realizó evaluación ecológica de los ecosistemas marinos (arrecifes coralinos y pastos marinos) que se encuentran en el Área protegida Reserva Biológica Cayos Miskitos, con el fin de conocer su estado actual de conservación, considerando que el área de Cayos Miskitos fue azotado por el huracán Félix en el año 2007, además las actividades de pesca son cada vez mayores, convirtiéndose en una gran presión para los arrecifes coralinos.